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写真a

 
ASARI Masaru
 
Organization
School of Medicine Medical Course Basic Medicine Legal Medicine
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Degree

  • 博士(医学) ( 2011.3   旭川医科大学 )

  • 博士(薬学) ( 2008.9   北海道大学 )

Research Interests

  • NGS解析

  • DNA鑑定

  • 個人識別

  • ミトコンドリアDNA多型

  • SNP

  • 法医学

Research Areas

  • Life Science / Forensics medicine

Education

  • 北海道大学大学院薬学研究科

    2001.4 - 2003.3

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  • 北海道大学薬学部

    1997.4 - 2001.3

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Research History

  • 旭川医科大学法医学講座准教授

    2015.1

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  • 旭川医科大学法医学講座助手

    2003.4 - 2014.12

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Committee Memberships

  • 厚生労働省   身元特定DNA鑑定会議構成員  

    2023.4 - 2025.3   

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  •   日本法医学会評議員  

    2020.4   

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Papers

  • Second- and third-degree kinship analysis by NGS-based SNP genotyping and evaluation of 2045-SNP performance on limited or degraded DNA Reviewed

    Masaru Asari, Yuta Takahashi, Ryo Namba, Chisato Hoshina, Kanae Mori, Katsuhiro Okuda, Keiko Shimizu

    Forensic Science International   367   112346 - 112346   2025.2

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.forsciint.2024.112346

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  • DNA methylation-based age estimation and quantification of the degradation levels of bisulfite-converted DNA Reviewed

    Mihiro Shiga, Masaru Asari, Yuta Takahashi, Shotaro Isozaki, Chisato Hoshina, Kanae Mori, Ryo Namba, Katsuhiro Okuda, Keiko Shimizu

    Legal Medicine   67   102336 - 102336   2024.3

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    Authorship:Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.legalmed.2023.102336

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  • Age prediction by methylation analysis of small amounts of DNA using locked nucleic acids Reviewed

    Yuta Takahashi, Masaru Asari, Shotaro Isozaki, Chisato Hoshina, Katsuhiro Okuda, Kanae Mori, Ryo Namba, Wataru Ochiai, Keiko Shimizu

    Journal of Forensic Sciences   68 ( 1 )   267 - 274   2023.1

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    Authorship:Corresponding author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Wiley  

    Abstract

    Age prediction based on methylation analysis has been reported in many populations, with 10 ng or more of DNA usually required for each determination. In this study, we designed thermostable locked nucleic acid (LNA) primers by replacing a small number of DNA bases in standard DNA primers with LNAs. We evaluated these primer sets by single‐base extension analysis using 10, 5, or 2 ng of DNA that would be less than template DNA used in standard methylation testing, and determined sensitivity and accuracy. We analyzed EDARADD, SST, and KLF14 genes, targeting one CpG site in each gene. Melting temperature values of most LNA primers were 4°C higher than those of DNA primers. The intensities of signals from the EDARADD and SST genes were significantly improved by the LNA primers, by 3.3 times and 1.4 times, respectively, compared with the DNA primers using 2 ng of DNA. Coefficient of variation (CV) analysis was used to assess the accuracy of the determined methylation levels. CVs were increased using small amounts of DNA, but lower CVs were detected using LNA primers. We also showed high accuracy of age prediction for 51 individuals using LNA primers. The lowest mean absolute deviation was obtained using 10 ng of DNA and was 3.88 years with the LNA primers. Thermostable PCR primers were simply designed, and the LNAs improved the sensitivity and accuracy of methylation analysis for 10 ng or less of DNA.

    DOI: 10.1111/1556-4029.15144

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    Other Link: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/1556-4029.15144

  • Multidirectional analysis for a colchicine poisoning case revealed detail cause of death and its mechanism Reviewed

    Katsuhiro Okuda, Shotaro Isozaki, Masaru Asari, Hiroki Tanaka, Kie Horioka, Yuta Takahashi, Chisato Hoshina, Hiromi Yamada, Kanae Mori, Ryo Namba, Hiroshi Shiono, Katsuhiro Ogawa, Keiko Shimizu

    Legal Medicine   58   102092 - 102092   2022.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.legalmed.2022.102092

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  • Hypothermia‐induced activation of the splenic platelet pool as a risk factor for thrombotic disease in a mouse model Reviewed

    Kie Horioka, Hiroki Tanaka, Shotaro Isozaki, Katsuhiro Okuda, Masaru Asari, Hiroshi Shiono, Katsuhiro Ogawa, Keiko Shimizu

    Journal of Thrombosis and Haemostasis   17 ( 10 )   1762 - 1771   2019.10

     More details

    Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    DOI: 10.1111/jth.14555

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    Other Link: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/jth.14555

  • Overproduction of thrombopoietin by <i>BRAFV600E</i>‐mutated mouse hepatocytes and contribution of thrombopoietin to hepatocarcinogenesis Reviewed

    Hiroki Tanaka, Kie Horioka, Masahiro Yamamoto, Masaru Asari, Katsuhiro Okuda, Kosuke Yamazaki, Keiko Shimizu, Katsuhiro Ogawa

    Cancer Science   110 ( 9 )   2748 - 2759   2019.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Wiley  

    Abstract

    In hepatocarcinogenesis induced by diethylnitrosamine (DEN) in B6C3F1 mice, the BrafV637E mutation, corresponding to the human BRAFV600E mutation, plays a pivotal role. The livers of transgenic mice with a hepatocyte‐specific human BRAFV600E mutation weighed 4.5 times more than that of normal mice and consisted entirely of hepatocytes, resembling DEN‐induced preneoplastic hepatocytes. However, these transgenic mice spontaneously died 7 wk after birth, therefore this study aimed to clarify the causes of death. In the transgenic mice, the liver showed thrombopoietin (TPO) overexpression, which is associated with eventual megakaryocytosis and thrombocytosis, and activated platelets were deposited in hepatic sinusoids. TPO was also overexpressed in the DEN‐induced hepatic tumors, and sinusoidal platelet deposition was observed in the hepatic tumors of humans and mice. Podoplanin was expressed in some of the Kupffer cells in the liver of the transgenic mice, indicating that platelet activation occurred via the interaction of podoplanin with C‐type lectin receptor 2 (CLEC‐2) on the platelet membrane. Additionally, erythrocyte dyscrasia and glomerulonephropathy/interstitial pneumonia associated with platelet deposition were observed. In the transgenic mice, aspirin (Asp) administration prevented platelet activation, reduced the liver/body weight ratio, decreased the platelet deposition in the liver, kidney, and lung, and prevented erythrocyte dyscrasia and ameliorated the renal/pulmonary changes. Thrombopoietin overproduction by BRAFV600E‐mutated hepatocytes may contribute to hepatocyte proliferation via thrombocytosis, platelet activation, and the interaction of platelets with hepatic sinusoidal cells, while hematologic, renal, and pulmonary disorders due to aberrant platelet activation may lead to spontaneous death in the transgenic mice.

    DOI: 10.1111/cas.14130

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    Other Link: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/cas.14130

  • Acute Colchicine Poisoning Causes Endotoxemia via the Destruction of Intestinal Barrier Function: The Curative Effect of Endotoxin Prevention in a Murine Model Reviewed

    Kie Horioka, Hiroki Tanaka, Shotaro Isozaki, Hiroaki Konishi, Mikihiro Fujiya, Katsuhiro Okuda, Masaru Asari, Hiroshi Shiono, Katsuhiro Ogawa, Keiko Shimizu

    Digestive Diseases and Sciences   65 ( 1 )   132 - 140   2019.7

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    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Springer Science and Business Media LLC  

    DOI: 10.1007/s10620-019-05729-w

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    Other Link: http://link.springer.com/article/10.1007/s10620-019-05729-w/fulltext.html

  • Discrimination of haplotype in mitochondrial DNA mixtures using LNA-mediated PCR clamping Reviewed

    Masaru Asari, Shotaro Isozaki, Chisato Hoshina, Katsuhiro Okuda, Hiroki Tanaka, Kie Horioka, Hiroshi Shiono, Keiko Shimizu

    Forensic Science International: Genetics   41   58 - 63   2019.7

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    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.fsigen.2019.03.018

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  • Assessment of DNA degradation of buccal cells under humid conditions and DNA repair by DOP-PCR using locked nucleic acids. Reviewed International journal

    Masaru Asari, Hiroaki Matsuura, Shotaro Isozaki, Chisato Hoshina, Katsuhiro Okuda, Hiroki Tanaka, Kie Horioka, Hiroshi Shiono, Keiko Shimizu

    Legal medicine (Tokyo, Japan)   35   29 - 33   2018.11

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    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    We analyzed the degradation level of DNA from buccal cells under humid conditions using quantitative PCR analysis. Gauze samples with buccal cells were incubated for up to 12 months under three different conditions (25 °C/dry, 25 °C/humid, or 40 °C/humid). The degradation was evaluated based on two degradation ratios (129:41 and 305:41 bp). DNA degraded slowly under the 25 °C/humid condition, and significant differences in the two degradation ratios were detected between 25 °C/dry and 25 °C/humid conditions after 12 months. Moreover, the degradation rapidly progressed under the 40 °C/humid condition, and the two degradation ratios in this condition were much lower than those from 25 °C/dry and 25 °C/humid conditions after a short incubation period (3 months). To evaluate the effect of DNA repair on low-copy degraded DNA, degenerate oligonucleotide-primed PCR (DOP-PCR) was performed before short tandem repeats (STR) genotyping. As a standard DOP-PCR, we used a 22-base primer with 10 degenerate sequences (5'-CTCGAGNNNNNNNNNNATGTGG-3'), and additionally designed DOP-PCR primers with 2, 4, 6, or 8 locked nucleic acids (LNAs). When slightly degraded DNA (305:41-bp ratio = 0.60) was used, DOP-PCR significantly increased the fluorescent intensity and success rate of genotyping using Identifiler and Globalfiler kits. In particular, the reaction with four LNAs produced the highest value. However, such benefits were not observed in the analysis of moderately degraded DNA (305:41-bp ratio = 0.13). Although the recovery rates of STR profiles by DOP-PCR were dependent on the degradation level of low-copy DNA, the effectiveness of DOP-PCR highlights the potential of LNA for degenerate sequences.

    DOI: 10.1016/j.legalmed.2018.09.005

    PubMed

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  • Paraquat toxicity is attenuated by 4-phenylbutyrate-induced phosphorylation of ERK2 via PI3K in A549 cells. Reviewed International journal

    Chisato Hoshina, Tomohiro Omura, Katsuhiro Okuda, Hiroki Tanaka, Masaru Asari, Shotaro Isozaki, Kie Horioka, Hiromi Yamada, Hiroki Doi, Hiroshi Shiono, Kazuo Matsubara, Keiko Shimizu

    Biochemical and biophysical research communications   503 ( 2 )   809 - 814   2018.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    Paraquat (PQ) is a widely used herbicide in the world despite being highly toxic to humans. PQ causes fatal damage to multiple organs, especially the lungs. While oxidative stress is the main toxic mechanism of PQ, there is no established standard therapy for PQ poisoning. In this study, we investigated the cytoprotective effect of 4-phenylbutyrate (4PBA) on PQ toxicity in human lung adenocarcinoma A549 cells. Phosphorylation levels of major survival signaling kinases Akt and ERK, as well as expression levels of antioxidant enzymes catalase and superoxide dismutase 2 (SOD2) were examined. The cytoprotective mechanism of 4PBA against PQ was compared with the antioxidant reagent trolox. We demonstrated that both 4PBA and trolox attenuated PQ toxicity, but their mechanisms were different. 4PBA increased ERK2 phosphorylation levels, which could be inhibited by the PI3K inhibitor LY294002. The cytoprotective effect of 4PBA was also inhibited by LY294002. Catalase expression levels were increased by 4PBA, although this increase was not inhibited by LY294002. 4PBA did not increase SOD2 expression. Trolox did not affect phosphorylation of Akt or ERK, or the expression of antioxidant enzymes. These results suggest that 4PBA attenuated PQ cytotoxicity by ERK2 activation via PI3K. Our study may provide new findings for understanding the molecular mechanism underlying cytoprotection by 4PBA, as well as new therapeutic targets for PQ poisoning.

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2018.06.080

    PubMed

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  • Chained nuclei and python pattern in skeletal muscle cells as histological markers for electrical injury. Reviewed International journal

    Hiroki Tanaka, Katsuhiro Okuda, Seiji Ohtani, Masaru Asari, Kie Horioka, Shotaro Isozaki, Akira Hayakawa, Katsuhiro Ogawa, Shiono Hiroshi, Keiko Shimizu

    Legal medicine (Tokyo, Japan)   32   75 - 78   2018.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    Electrical injury is damage caused by an electrical current passing through the body. We have previously reported that irregular stripes crossing skeletal muscle fibers (python pattern) and multiple small nuclei arranged in the longitudinal direction of the muscle fibers (chained nuclear change) are uniquely observed by histopathological analysis in the skeletal muscle tissues of patients with electrical injury. However, it remains unclear whether these phenomena are caused by the electrical current itself or by the joule heat generated by the electric current passing through the body. To clarify the causes underlying these changes, we applied electric and heat injury to the exteriorized rat soleus muscle in situ. Although both the python pattern and chained nuclear change were induced by electric injury, only the python pattern was induced by heat injury. Furthermore, a chained nuclear change was induced in the soleus muscle cells by electric current flow in physiological saline at 40 °C ex vivo, but a python pattern was not observed. When the skeletal muscle was exposed to electrical injury in cardiac-arrested rats, a python pattern was induced within 5 h after cardiac arrest, but no chained nuclear change was observed. Therefore, a chained nuclear change is induced by an electrical current alone in tissues in vital condition, whereas a python pattern is caused by joule heat, which may occur shortly after death. The degree and distribution of these skeletal muscle changes may be useful histological markers for analyzing cases of electrical injury in forensic medicine.

    DOI: 10.1016/j.legalmed.2017.11.001

    PubMed

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  • Liquid chromatography-tandem mass spectrometry method for the determination of thiosulfate in human blood and urine as an indicator of hydrogen sulfide poisoning. Reviewed International journal

    Chikatoshi Maseda, Akira Hayakawa, Katsuhiro Okuda, Masaru Asari, Hiroki Tanaka, Hiromi Yamada, Shigeki Jin, Kie Horioka, Kotaro Matoba, Hiroshi Shiono, Kazuo Matsubara, Keiko Shimizu

    Legal medicine (Tokyo, Japan)   24   67 - 74   2017.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier BV  

    Being a stable metabolite of hydrogen sulfide, thiosulfate has been utilized as an index for hydrogen sulfide poisoning (HSP). Thiosulfate analysis is mainly performed using gas chromatography/mass spectrometry (GC-MS) due to its high sensitivity and specificity. The GC-MS analysis requires two-step derivatizations of thiosulfate, and the derivative is not stable in solution as it has a disulfide moiety. To resolve this stability issue, we developed a novel analytical method using liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) for monitoring the pentafluorobenzyl derivative of thiosulfate (the first reaction product of the GC-MS method) in this study. The established method exhibited high reproducibility despite being a more simplified and rapid procedure compare to the GC-MS method. Phenyl 4-hydroxybenzoate was used as an internal standard because 1,3,5-tribromobenzene which had been used in the GC-MS method was not suitable compound for LC-MS/MS with Electrospray ionization (ESI) negative detection. The linear regression of the peak area ratios versus concentrations was fitted over the concentration ranges of 0.5-250μM and 0.25-250μM in blood and urine, respectively. The validation results satisfied the acceptance criteria for intra- and inter-day accuracy and precision. Blood and urine samples from 12 suspected HSP cases were tested using this method. The thiosulfate concentration detected in the sample coincided well with that determined at the scene of each HSP accident.

    DOI: 10.1016/j.legalmed.2016.12.004

    PubMed

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MISC

  • 旭川医科大学の法医解剖における中毒事例の統計解析

    奥田 勝博, 間瀬田 千香暁, 浅利 優, 田中 宏樹, 山田 ひろみ, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子

    法医学の実際と研究   ( 63 )   182 - 182   2020.11

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    Language:Japanese   Publisher:法医学談話会  

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  • 兄弟姉妹からの試料提供による身元確認のためのDNA鑑定

    浅利 優, 奥田 勝博, 田中 宏樹, 堀岡 希衣, 山田 ひろみ, 塩野 寛, 清水 惠子

    法医学の実際と研究   ( 63 )   180 - 180   2020.11

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    Language:Japanese   Publisher:法医学談話会  

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  • 配列特異的な増幅阻害に基づいた混合試料からのミトコンドリアDNA型解析

    浅利 優, 奥田 勝博, 田中 宏樹, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子

    DNA多型   28 ( 1 )   120 - 122   2020.7

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    Language:Japanese   Publisher:(一社)日本DNA多型学会  

    ミトコンドリアDNAのHV1領域に対して配列特異的な増幅阻害が可能であるPCRクランピング法を用いて、2名の混合試料に含まれる個々のミトコンドリアDNA型を識別する方法を開発した。健常な日本人より口腔内細胞を採取し、QIAamp DNA Mini Kitを用いてDNAを回収した。PCRクランピング法には標的となる部位に対して人工核酸を含む19塩基までのDNAをプローブとして用いた。設計した5種類のプローブのうち、塩基番号16175-16192の配列を標的とするプローブは完全に一致する鋳型で阻害された以外に、1塩基が異なる16189Cを含む鋳型でも明確な阻害効果が認められた。また、反応特異性が高い多型を標的とした6種類のプローブでは、1:4や1:9でもわずかに含まれるハプロタイプを決定することが可能であった。設計した11種類のプローブを用いたPCRクランピング法は、日本人に高頻度で観察されるハプロタイプの増幅阻害が可能であった。

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  • 法医学講座を支える人々 役割分担とチームワーク

    山田 ひろみ, 保科 千里, 北村 麻奈, 吉田 あやか, 島津 雅子, 土井 大輝, 堀岡 希衣, 浅利 優, 奥田 勝博, 田中 宏樹, 磯崎 翔太郎, 塩野 寛, 清水 惠子

    法医学の実際と研究   ( 62 )   216 - 217   2019.11

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    Language:Japanese   Publisher:法医学談話会  

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  • 過去10年間の中毒統計解析から見えた中毒見逃し防止策

    奥田 勝博, 間瀬田 千香暁, 山田 ひろみ, 浅利 優, 田中 宏樹, 堀岡 希衣, 松原 和夫, 塩野 寛, 清水 惠子

    法医学の実際と研究   ( 62 )   179 - 184   2019.11

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    Language:Japanese   Publisher:法医学談話会  

    当講座における法医解剖事例中の中毒死事例について統計解析を行い、中毒死の傾向を得るとともに、事件背景や発見状況、肉眼解剖初見から中毒を想起し、見逃さないための防止策を考察した。法医解剖を実施した1998件のうち、外因の中毒死と診断された264件を解析対象とした。内訳はガス中毒169件(64%)、薬物中毒76件(29%)、農薬・洗剤等中毒10件(4%)、食中毒5件(2%)、アルコール中毒2件(1%)となった。ガス中毒で最も多い原因は一酸化炭素中毒(144件)で、その他、硫化水素中毒(13件)、火災による青酸中毒(6件)、炭化水素中毒(6件)が挙げられた。薬物中毒のほとんど(70%)は医療用医薬品の過量摂取による中毒死であった。農薬・洗剤等中毒の原因は殺虫剤7件、界面活性剤中毒3件であり、食中毒の5件はいずれもギョウジャニンニクやジャガイモと誤って有毒植物イヌサフランの若葉または球根を食した急性コルヒチン中毒によるものであった。

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  • 過去10年間に旭川医科大学で法医解剖がなされた中毒事例の統計解析

    奥田 勝博, 間瀬田 千香暁, 磯崎 翔太郎, 浅利 優, 田中 宏樹, 山田 ひろみ, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子

    中毒研究   32 ( 3 )   349 - 350   2019.9

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    Language:Japanese   Publisher:(株)へるす出版  

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  • 高湿度条件における口腔内細胞のDNA分解とDOP-PCRによるDNA修復

    浅利 優, 保科 千里, 磯崎 翔太郎, 奥田 勝博, 田中 宏樹, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子, 松浦 宏晃

    DNA多型   27 ( 1 )   109 - 111   2019.7

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    Language:Japanese   Publisher:(一社)日本DNA多型学会  

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  • デートレイプドラッグに関する法医学的公判対応

    清水 惠子, 奥田 勝博, 浅利 優, 田中 宏樹, 磯崎 翔太郎, 三上 八郎, 堀岡 希衣, 粟屋 敏雄, 塩野 寛, 松原 和夫

    日本法医学雑誌   73 ( 1 )   85 - 85   2019.5

     More details

    Language:Japanese   Publisher:(NPO)日本法医学会  

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  • 法医学的な検死における慢性甲状腺炎と抑うつ症状の関連性(Association between Chronic Thyroiditis and Depressive Symptoms in Forensic Autopsy)

    輿石 佳那, 沖本 大河, 金澤 風菜, 近藤 咲季, 田中 宏樹, 磯崎 翔太郎, 堀岡 希衣, 奥田 勝博, 浅利 優, 清水 惠子

    日本法医学雑誌   73 ( 1 )   63 - 63   2019.5

     More details

    Language:English   Publisher:(NPO)日本法医学会  

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  • PCRクランピング法を用いた混合試料からのミトコンドリアDNA型解析

    浅利 優, 磯崎 翔太郎, 保科 千里, 奥田 勝博, 田中 宏樹, 堀岡 希衣, 北村 麻奈, 島津 雅子, 塩野 寛, 清水 惠子

    日本法医学雑誌   73 ( 1 )   76 - 76   2019.5

     More details

    Language:Japanese   Publisher:(NPO)日本法医学会  

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  • 司法解剖となったジフェンヒドラミン過量服薬7事例におけるジフェンヒドラミンおよびその代謝物の組織分布

    奥田 勝博, 浅利 優, 田中 宏樹, 磯崎 翔太郎, 山田 ひろみ, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子

    日本薬学会年会要旨集   139年会 ( 4 )   143 - 143   2019.3

     More details

    Language:Japanese   Publisher:(公社)日本薬学会  

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  • 睡眠薬による一過性前向健忘と犯罪 GABAA受容体作動薬のレイプドラッグとしての不法使用

    奥田 勝博, 浅利 優, 田中 宏樹, 山田 ひろみ, 堀岡 希衣, 北村 麻奈, 吉田 あやか, 鈴木 朱美, 保科 千里, 土井 大輝, 磯崎 翔太郎, 塩野 寛, 松原 和夫, 清水 惠子

    日本法医学雑誌   72 ( 2 )   333 - 334   2018.12

     More details

    Language:Japanese   Publisher:(NPO)日本法医学会  

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  • ビニール袋による窒息2事例における詳細な薬物分析と薬物動態学的考察

    奥田 勝博, 浅利 優, 田中 宏樹, 山田 ひろみ, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子, 槇野 陽介, 磯崎 翔太郎

    法医学の実際と研究   ( 61 )   246 - 246   2018.11

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    Language:Japanese   Publisher:法医学談話会  

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  • 胃内容物からの有毒植物イヌサフランの識別と酸性条件下でのDNA分解

    浅利 優, 奥田 勝博, 田中 宏樹, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子

    DNA多型   26 ( 1 )   74 - 76   2018.7

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    Language:Japanese   Publisher:(一社)日本DNA多型学会  

    急性コルヒチン中毒死事例の胃内容物からギョウジャニンニクおよびイヌサフランの識別を試みた。さらに、酸性条件下(pH2から6)におけるDNAの分解の程度について定量的PCRを用いて検討した。急性コルヒチン中毒事例の胃内容物のうち、葉茎様のもの8片を試料とし、DNeasy Plant Mini Kitを使用してDNAを抽出した。属特異的配列に基づいて設計したFAMおよびVICで標識したプライマーの特異性を確認し、ネギ属から99bpの青色のピーク、コルチカム属から緑色の81bpのピークが検出された。DNAバーコーディング解析ではギョウジャニンニクおよびイヌサフランは確認できなかった。一方、属特異的な増幅では、ネギ属が2試料、コルチカム属が4試料から検出された。摂取したコルヒチン含有植物はイヌサフランである可能性が高いと考えられた。酸性処理した植物片からのコピー数の決定および分解度の測定を行った結果、96bpに基づいたコピー数は各pHで時間の経過とともに減少しており、特にpH2からpH5の120分では顕著に減少していた。それに対し、分解度を示す342bp/96bpはpH2で大きく減少していたが、pH3からpH6でわずかな減少、あるいは減少は認められなかった。以上より、必ずしも大きなpHでなくてもDNA量は大きく減少し、DNA分析が困難になると考えられた。

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  • 洗濯用液体洗剤の多飲により界面活性剤中毒を疑った医薬品中毒死事例

    奥田 勝博, 浅利 優, 田中 宏樹, 磯崎 翔太郎, 山田 ひろみ, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子

    中毒研究   31 ( 2 )   253 - 253   2018.7

     More details

    Language:Japanese   Publisher:(株)へるす出版  

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  • コルヒチン中毒における腸管バリア機能破綻の評価

    堀岡 希衣, 田中 宏樹, 奥田 勝博, 浅利 優, 塩野 寛, 清水 惠子

    日本組織細胞化学会総会・学術集会講演プログラム・予稿集   58回   65 - 65   2017.9

     More details

    Language:Japanese   Publisher:日本組織細胞化学会  

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  • 災害・集団発生中毒 火災事例における青酸定量の重要性 工場火災の2事例から

    奥田 勝博, 槇野 陽介, 浅利 優, 田中 宏樹, 山田 ひろみ, 堀岡 希衣, 塩野 寛, 清水 惠子

    中毒研究   30 ( 2 )   170 - 170   2017.6

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    Language:Japanese   Publisher:(株)へるす出版  

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  • 国内未承認睡眠薬のデートレイプドラッグとしての使用

    松原 和夫, 清水 惠子, 奥田 勝博, 浅利 優, 田中 宏樹, 堀岡 希衣, 粟屋 敏雄, 磯崎 翔太郎, 早川 輝, 塩野 寛

    日本法医学雑誌   71 ( 1 )   101 - 101   2017.5

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    Language:Japanese   Publisher:(NPO)日本法医学会  

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  • ラット脳マイクロダイアリシスによるジフェニジンの脳内報酬系への影響評価

    奥田 勝博, 田中 宏樹, 浅利 優, 堀岡 希衣, 早川 輝, 磯崎 翔太郎, 吉田 あやか, 松原 和夫, 塩野 寛, 清水 惠子

    日本法医学雑誌   71 ( 1 )   65 - 65   2017.5

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    Language:Japanese   Publisher:(NPO)日本法医学会  

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  • 旭川医科大学法医学講座における過去10年間のDNA鑑定および血縁者・関与者の数学的評価

    浅利 優, 大村 友博, 奥田 勝博, 田中 宏樹, 山田 ひろみ, 塩野 寛, 松原 和夫, 清水 惠子

    法医学の実際と研究   ( 59 )   175 - 178   2016.11

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    Language:Japanese   Publisher:法医学談話会  

    分析試料の総数は1538検体で、DNA鑑定は戦没者遺骨の判別が778検体で最も多く、次いで解剖死体468検体、現場遺留試料292検体の順であった。遺骨試料445検体のうち大半が歯牙であり、多くの場合1本から良好な常染色体STR型、Y染色体SR型およびmtDNA多型の結果が得られた。比較対照である遺族試料は333検体解析し、身元が特定されたのは113検体であった。解剖死体では238事例280検体から型判定を行い、試料は血液が43%で最も多かった。多くの場合、15座位のSTR判定により、対照試料を用いることで身元が判定された。分析した遺留試料は156検体で、毛髪を含む人毛が71検体と最も多く、次いで多いものがガーゼ片であった。人毛では2検体からのみSTR型が検出可能であったが、mtDNA多型は55検体から検出可能であった。対照試料は136検体で、大半が口腔内細胞であった。

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Presentations

  • 24座位のDNA型に基づいた確率計算と追加のSNP解析による身元確認への協力

    浅利 優, 難波 亮, 髙橋悠太, 山田ひろみ, 森 香苗, 奥田勝博, 清水恵子

    第108次日本法医学会学術全国集会  2024.6 

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    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 身元特定において性染色体がXX型を呈した男性の1例

    難波 亮, 浅利 優, 髙橋悠太, 森 香苗, 山田ひろみ, 保科千里, 奥田勝博, 清水恵子

    第25回日本法医学会学術北日本地方集会  2024.11 

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    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • NGS-based SNP gentyping for kinship analysis using small amouts of DNA

    2024.6 

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    Language:English   Presentation type:Poster presentation  

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  • 次世代シークエンサーを用いた2000座位のSNP解析と血縁判定への応用

    浅利 優, 高橋悠太, 難波 亮, 森 香苗, 保科千里, 奥田勝博, 清水惠子

    第107次日本法医学会学術全国集会  2023.6 

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    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 24座位のDNA型に基づいた確率計算と追加検査による身元確認への協力

    難波 亮, 浅利 優, 髙橋悠太, 山田ひろみ, 森 香苗, 奥田勝博, 清水恵子

    第24回日本法医学会学術北日本地方集会  2023.11 

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    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • DNA Methylation-based age estimation and detection of degradation levels using Japanese individuals

    難波 亮, 浅利 優, 志賀美紘, 高橋悠太, 森 香苗, 保科千里, 奥田勝博, 清水惠子

    第107次日本法医学会学術全国集会  2023.6 

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    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

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  • DNAのメチル化解析を用いた日本人集団における年齢推定とDNA分解による影響

    志賀美紘, 浅利 優, 髙橋悠太, 難波 亮, 森 香苗, 保科千里, 奥田勝博, 清水惠

    第23回日本法医学会学術北日本地方集会  2022.11 

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    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

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Awards

  • 札幌方面中央警察署長感謝状

    2024.3  

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  • 北海道警察本部刑事部長感謝状

    2021.1  

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Research Projects

  • タッチサンプルからの単一細胞やヒト常在微生物叢を標的とした個人識別法の開発

    Grant number:22K10600  2022.4 - 2025.3

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    浅利 優

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    Grant amount:\4,030,000 ( Direct Cost: \3,100,000 、 Indirect Cost:\930,000 )

    次世代シークエンサーを用いた個人識別に有効な一塩基多型(SNP)解析法の構築および効率的な細胞単離法の検討を行った。まず、常染色体上にあり、日本人集団においてヘテロ接合度が高く、互いに3センチモルガン程度離れて位置するSNPを対象として検索した。これらのSNPのうち、1153座位を含むプライマーセットを用い、健常な日本人158人より採取した口腔内細胞から次世代シークエンサーiSeq 100(イルミナ)を使用して型判定を行った。1反応あたり10ngのDNAを使用し、AmpliSeq Library PLUS for Illumina(イルミナ)を用いてマニュアルに従って行うことでライブラリー調製を行い、8から12検体を一度に解析した。検出できない領域および平均深度が低い領域を除いて1100座位を選択可能であった。1100座位の平均深度は417、ヘテロ接合体の2つのシグナルの比であるアリルカバレッジレシオは0.8以上が99%と高い数値であった。また、細胞の単離および回収は口腔内細胞を採取直後にゲルフィルム(Gel-Pak)に圧着させ、トリパンブルーで染色したものを試料として、顕微鏡観察下で細胞1つを採取する方法を検討した。微細作業にはメカニカルマニュピュレーターであるラビトル3D(マイクロサポート)を使用した。単一細胞の確認は採取したものを溶解後にSTR型解析により行った。タングステンニードルによる採取、真空吸着法、精密ピンセットによる把持を比較したところ、精密ピンセットを用いた採取が短時間かつ確実に採取可能であることが確認できた。

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  • 戦没者遺骨の身元特定に係るDNA鑑定の精度向上に関する研究

    Grant number:21AA2004  2021.4 - 2024.3

    厚生労働省  厚生労働行政推進調査事業費補助金  政策科学総合研究事業(政策科学推進研究事業)

    浅利 優

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    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Competitive

    Grant amount:\9,420,000 ( Direct Cost: \8,720,000 、 Indirect Cost:\700,000 )

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  • 戦没者遺骨のDNA鑑定の方法に係る研究事業

    2020.4 - 2021.3

    厚生労働省(信州大学からの再委託となる受託研究) 

    浅利 優

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    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\3,356,760 ( Direct Cost: \3,356,760 )

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Media Coverage

  • 時を結ぶ(2)「DNA鑑定」 Newspaper, magazine

    共同通信  47News  2019.9

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Academic Activities

  • Genes(basel)・査読 International contribution

    Role(s): Peer review

    2025.2

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    Type:Peer review 

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  • Forensic Science・査読 International contribution

    Role(s): Peer review

    2025.1

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    Type:Peer review 

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  • Molecular Biology Reports・査読 International contribution

    Role(s): Peer review

    2024.9

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    Type:Peer review 

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  • 第107次日本法医学会学術全国集会・一般口演座長

    2023.6

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    Type:Academic society, research group, etc. 

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  • Scientific Reports・Reviewer International contribution

    Role(s): Peer review

    2023.4

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    Type:Peer review 

    2023年8月 査読1件
    2024年6月 査読1件

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  • Forensic Science International・査読 International contribution

    Role(s): Peer review

    2023.4

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    Type:Peer review 

    2023年4月 査読1件
    2025年3月 査読1件
    2025年4月 査読1件

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  • 日本DNA多型学会第31回全国集会・一般口演座長

    2022.11

     More details

    Type:Academic society, research group, etc. 

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  • 第20回日本法医学会北日本地方集会・一般口演座長

    2019.11

     More details

    Type:Academic society, research group, etc. 

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  • 第55回日本犯罪学会総会・一般口演座長

    2018.11

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    Type:Academic society, research group, etc. 

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  • Legal Medicine・査読

    Role(s): Peer review

    2018.4

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    Type:Peer review 

    2022年4月~2023年3月 査読19件
    2023年4月~2024年3月 査読16件
    2024年4月~2025年3月 査読14件

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