2025/03/05 更新

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タカハシ ユウタ
髙橋 悠太
TAKAHASHI Yuta
所属
医学部 医学科 基礎医学講座 法医学講座
外部リンク

学位

  • 学士(薬学)

研究分野

  • ライフサイエンス / 法医学

学歴

  • 星薬科大学   薬学部   薬学科

    2009年4月 - 2015年3月

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  • 星薬科大学大学院   薬学研究科   薬学専攻

    2021年4月

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    備考: 博士課程

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経歴

  • 旭川医科大学   法医学講座   助教

    2020年8月 - 現在

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  • 神戸学院大学   薬学部   実習助手

    2019年4月 - 2020年7月

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  • 東海大学医学部付属病院   薬剤部薬剤科   薬剤師

    2016年4月 - 2019年3月

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所属学協会

  • 日本エピジェネティクス研究会

    2021年4月 - 現在

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  • 日本分子生物学会

    2021年4月 - 現在

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  • 日本法医学会

    2020年8月 - 現在

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  • 日本DNA多型学会

    2020年8月 - 現在

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論文

  • Second- and third-degree kinship analysis by NGS-based SNP genotyping and evaluation of 2045-SNP performance on limited or degraded DNA. 国際誌

    Masaru Asari, Yuta Takahashi, Ryo Namba, Chisato Hoshina, Kanae Mori, Katsuhiro Okuda, Keiko Shimizu

    Forensic science international   367   112346 - 112346   2025年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We developed a novel next-generation sequencing-based single-nucleotide polymorphism (SNP) genotyping method for second- and third-degree kinship analysis, and designed 1144- and 2045-SNP panels using one (Set A) and two sets (Sets A and B) of primers. These SNP loci were analyzed in 120 Japanese individuals, and likelihood ratios (LRs) for kinship discrimination were calculated to evaluate the effect of number of SNP loci in simulated analysis. Likelihood evaluation was performed using DNA profiles from two individuals, namely, the unknown and one reference relative. Genotyping of the 1144 and 2045 SNPs was informative to discriminate aunt-nephew/niece as second-degree relatives and unrelated pairs. In third-degree relationship analysis, distributions of log10LRs between the unknown and a first cousin (FC) were not separated from those of unrelated individuals even in 2045-SNP genotyping. To perform enhanced discrimination of third-degree relationships, we also evaluated the effectiveness of DNA profiles from three individuals, namely, the unknown and two first cousins (2FC). A likelihood evaluation from the 2045 SNPs using 2FC was more useful than the use of FC. Our method was applied to 12 kinship cases for second- and third-degree relationship analysis, and LRs from 1144- and 2045-SNP genotypes were markedly higher than those from conventional short tandem repeat profiles. Moreover, we evaluated the performance of the 2045 SNPs using limited or degraded DNA, compared with that with a larger amount of DNA. Using 0.1 ng of non-degraded DNA, the average concordance was higher than 97 %. In analysis with heavily degraded DNA (degradation index=32.2), we also detected high concordance (85.5 %) from 2045-SNP genotypes, compared with the lower rate (52.4 %) from 21 short tandem repeat profiles. Our method should be highly sensitive with discriminatory DNA profiles for analyzing second- and third-degree relationships.

    DOI: 10.1016/j.forsciint.2024.112346

    PubMed

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  • DNA methylation-based age estimation and quantification of the degradation levels of bisulfite-converted DNA 査読

    Mihiro Shiga, Masaru Asari, Yuta Takahashi, Shotaro Isozaki, Chisato Hoshina, Kanae Mori, Ryo Namba, Katsuhiro Okuda, Keiko Shimizu

    Legal Medicine   67   102336 - 102336   2024年3月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.legalmed.2023.102336

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  • Age prediction by methylation analysis of small amounts of DNA using locked nucleic acids 査読

    Yuta Takahashi, Masaru Asari, Shotaro Isozaki, Chisato Hoshina, Katsuhiro Okuda, Kanae Mori, Ryo Namba, Wataru Ochiai, Keiko Shimizu

    Journal of Forensic Sciences   68 ( 1 )   267 - 274   2023年1月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • アルコール感受性遺伝子型を考慮した血中アルコール濃度推定による事件遭遇時の被害者の行動能力 査読

    森 香苗, 奥田勝博, 浅利 優, 髙橋悠太, 難波 亮, 清水惠子

    法医学の実際と研究   2023年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Multidirectional analysis for a colchicine poisoning case revealed detail cause of death and its mechanism 査読

    Katsuhiro Okuda, Shotaro Isozaki, Masaru Asari, Hiroki Tanaka, Kie Horioka, Yuta Takahashi, Chisato Hoshina, Hiromi Yamada, Kanae Mori, Ryo Namba, Hiroshi Shiono, Katsuhiro Ogawa, Keiko Shimizu

    Legal Medicine   58   102092 - 102092   2022年9月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.legalmed.2022.102092

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  • 毛髪分析によって薬物の摂取時期を推定した2事例 査読

    奥田勝博, 浅利 優, 髙橋悠太, 森 香苗, 難波 亮, 清水惠子

    法医学の実際と研究   ( 65 )   125 - 130   2022年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • 第二度血縁者を用いた血縁判定による身元特定と骨資料からのハプログループ推定 査読

    浅利 優, 髙橋悠太, 奥田勝博, 保科千里, 山田ひろみ, 森 香苗, 難波 亮, 塩野 寛, 清水惠子

    法医学の実際と研究   ( 64 )   17 - 20   2021年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • 潜水器材に付着したDNAの採取と定量解析 査読

    宮本賢聖, 浅利 優, 奥田勝博, 髙橋悠太, 森 香苗, 難波 亮, 保科千里, 山田ひろみ, 石川 知保, 清水惠子

    法医学の実際と研究   ( 64 )   11 - 16   2021年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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MISC

  • [非ベンゾジアゼピン系・ベンゾジアゼピン系睡眠薬]記憶障害(一過性前向性健忘)

    清水惠子, 奥田勝博, 浅利 優, 髙橋悠太, 松原和夫

    月刊薬事   63 ( 6 )   1065 - 1069   2021年5月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(商業誌、新聞、ウェブメディア)   出版者・発行元:株式会社じほう  

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講演・口頭発表等

  • Evaluation of the effects on the dopaminergic reward system and the blood-brain barrier permeability of diphenidine derivatives using rat brain microdialysis 国際会議

    Yuta Takahashi, Katsuhiro Okuda, Masaru Asari, Kanae Mori, Ryo Namba, Wataru Ochiai, Keiko Shimizu

    Neuroscience 2023 

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    開催年月日: 2023年11月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:Washington D.C.  

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  • ブレインマイクロダイアリシスを用いたジフェニジン誘導体の作用および脳移行メカニズム解析

    髙橋悠太, 奥田勝博, 浅利 優, 森 香苗, 難波 亮, 清水惠子

    第107次日本法医学会学術全国集会 

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    開催年月日: 2023年6月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • ジフェニジン誘導体の脳内報酬系への作用と脳移行における構造活性相関

    髙橋悠太, 奥田勝博, 浅利 優, 森 香苗, 難波 亮, 清水惠子

    第 23 回日本法医学会学術北日本地方集会 

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    開催年月日: 2022年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • メチル化解析を用いた年齢推定における人工核酸の導入およびDNA量の影響

    髙橋悠太, 浅利 優, 奥田勝博, 志賀美紘, 保科千里, 難波 亮, 森 香苗, 清水惠子

    第106次日本法医学会学術全国集会 

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    開催年月日: 2022年6月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • メチル化解析を用いた年齢推定における感度・精度の向上を目指した人工核酸の活用

    髙橋悠太, 浅利 優, 奥田勝博, 保科千里, 森 香苗, 難波 亮, 清水惠子

    第22回日本法医学会学術北日本地方集会 

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    開催年月日: 2021年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • DNA methylation-based age prediction in the Japanese population by pyrosequencing analysis 国際会議

    Yuta Takahashi, Masaru Asari, Katsuhiro Okuda, Kanae Mori, Ryo Namba, Keiko Shimizu

    The 100th annual conference of the DGRM 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • 日本人集団におけるDNAのメチル化解析を用いた年齢推定および解析方法の改良

    髙橋悠太, 浅利 優, 奥田勝博, 志賀美紘, 保科千里, 森 香苗, 難波 亮, 北村麻奈, 島津雅子, 清水惠子

    第105次日本法医学会学術全国集会 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 妊婦てんかん発作を未然防止するカンナビジオール至適投与のための胎児動態の詳細解析

    研究課題/領域番号:24K09970  2024年4月 - 2027年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    落合 和, 高橋 悠太

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    担当区分:研究分担者 

    配分額:4,550,000円 ( 直接経費:3,500,000円 、 間接経費:1,050,000円 )

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  • タッチサンプルからの単一細胞やヒト常在微生物叢を標的とした個人識別法の開発

    研究課題/領域番号:22K10600  2022年4月 - 2025年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    浅利 優

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    担当区分:研究分担者 

    配分額:4,030,000円 ( 直接経費:3,100,000円 、 間接経費:930,000円 )

    次世代シークエンサーを用いた個人識別に有効な一塩基多型(SNP)解析法の構築および効率的な細胞単離法の検討を行った。まず、常染色体上にあり、日本人集団においてヘテロ接合度が高く、互いに3センチモルガン程度離れて位置するSNPを対象として検索した。これらのSNPのうち、1153座位を含むプライマーセットを用い、健常な日本人158人より採取した口腔内細胞から次世代シークエンサーiSeq 100(イルミナ)を使用して型判定を行った。1反応あたり10ngのDNAを使用し、AmpliSeq Library PLUS for Illumina(イルミナ)を用いてマニュアルに従って行うことでライブラリー調製を行い、8から12検体を一度に解析した。検出できない領域および平均深度が低い領域を除いて1100座位を選択可能であった。1100座位の平均深度は417、ヘテロ接合体の2つのシグナルの比であるアリルカバレッジレシオは0.8以上が99%と高い数値であった。また、細胞の単離および回収は口腔内細胞を採取直後にゲルフィルム(Gel-Pak)に圧着させ、トリパンブルーで染色したものを試料として、顕微鏡観察下で細胞1つを採取する方法を検討した。微細作業にはメカニカルマニュピュレーターであるラビトル3D(マイクロサポート)を使用した。単一細胞の確認は採取したものを溶解後にSTR型解析により行った。タングステンニードルによる採取、真空吸着法、精密ピンセットによる把持を比較したところ、精密ピンセットを用いた採取が短時間かつ確実に採取可能であることが確認できた。

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